Deficitul selectiv de imunoglobulina A este de 10-15 ori mai frecvent întâlnit la pacienţii cu boală celiacă decât la subiecţii sănătoşi. Dacă metodele serologice utilizate în diagnosticul bolii celiace se limitează la detecţia izotipurilor IgA ale anticorpilor, pacienţii cu deficit de IgA vor avea reacţii fals negative. Pentru a preveni rezultatele fals negative este necesară determinarea anticorpilor de tip IgG3.

Anticorpii anti-endomisium IgG prezintă titruri semnificativ crescute la pacienţii cu boală celiacă care asociază deficit selectiv de IgA². Pot fi utilizaţi atât pentru diagnostic cât şi pentru monitorizarea complianţei la dieta fără gluten3.